棉花秸秆能作为香菇，平菇，木耳，灵芝等木腐菌的培养料。其养分比棉籽壳略高。比木屑好。在配方中用40％棉籽壳，40％的木屑栽培香菇。产量比单用木屑的高40％左右。栽培香菇的参考配方如下：40％棉杆。40％木屑 18％麦麸，1％塘 1％石膏。
棉花秸秆的C/N比无法查到。与玉米秸秆的C/N相似。
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