要了解双孢蘑菇的制种技术，首先要明确什么叫菌种？食用菌的菌丝体生长在适当的培养基中，而用于栽培的产生食用菌子实体的叫做菌种，所谓菌种，包括二个方面的内容：一是菌丝体，二是菌丝体生长的培养基(料)。

蘑菇菌种制作的流程是:母种→原种→栽培种。

母种是应用菌类的孢子或组织(包括子实体、菌索和菌核)在琼脂培养基上萌发、分离提纯后得到的菌丝体。母种常用的培养基是马铃薯、葡萄糖、琼脂培养基(简称PDA培养基)，一般蘑菇制种常用的方法是用多孢挑单菌落的方法，来取得母种的菌丝体，而不是用组织分离的方法。一般生产上的用种都应该到科研单位、大专院校，或有制种能力的单位买回经过出菇试验的母种试管，买回后只能扩管一次。扩管的次数太多，会发生变异，影响菌种的质量。一支母种试管能扩30－50支母种(一级种)。

原种（二级种）是将母种菌丝体（连同培养基）扩大到瓶装培养基上培育而成。在相同的培养基上再扩大一次，称为栽培种（三级种），一般一支母种（一级种）能扩3－4瓶原种（二级种），一瓶原种能扩50瓶栽培种（三级种）。

目前，生产上常用的栽培种是谷粒菌种，现简述如下：

配方：熟麦粒9公斤（也可用小麦、燕麦、高梁、小米等）、硫酸钙30克、石膏120克，取无虫、无霉、无杂的谷粒清洗干净，用PH值在9以上的石灰清水浸泡12－16小时（视制种时的温度而定），浸泡后捞起，沥干，冲洗 ，然后放在锅中烧，烧开后继续煮，煮到麦粒胀大，而皮不破（煮的过程中要一直搅动）。捞起，沥干，摊开，晾干，拣去破裂的麦粒，即为熟麦粒。将预先准备好的石膏、碳酸钙与麦粒混合，拌匀后装瓶，塞上棉塞，进行消毒灭菌（消毒灭菌的压力为1.5公斤/厘米2，保温2小时），再缓慢放气，冷却后取出菌种瓶。

谷粒菌种易衰老，出黄色。在含水量大、气温高、贮藏期长的情况下，这种情况尤为严重。所以应根据抪种期来安排制种时间，争取在菌丝长到底后10-15天内进行抪种，以防菌种活性降低。

为防止菌种老化，生产上常用的方法是在麦粒里混入5%左右、经石灰水处理的麦桔碎片和5－10%左右的经晒干粉碎的蘑菇培养料。

谷粒菌种制作的关键技术是熟麦粒的含水量。如麦粒含水量偏干，菌丝长得就慢，如偏湿，麦粒易破裂，甚至麦粒粘在一起易污染菌种。