猪的一年二次的群防免疫是猪疾病预防控制的重要措施之一。但这种集中全防全免措施也存在发病地区、场及发病猪如何处置；由于免疫时段面临各年龄段、各生长阶段及各种免疫状态的猪又应该如何处置，特别是母猪在怀孕期间要不要注射疫苗一直有争议。

怀孕的母猪要不要注射疫苗要从几个方面来探讨：

疫苗是一种异源性蛋白质。疫苗虽可以提高对相应病原的免疫力，同时异源蛋白质也会产生以热反应等的负反应，甚至造成个别猪的死亡的案例，这是对猪，包括怀孕母猪不利的一面。

活毒疫（菌）苗诱发初生仔猪感染。曾有报道，怀孕后期母猪注射猪瘟疫苗，初生仔猪发生慢性猪瘟。这里原因很多，但研究者认为与注射疫苗有关；另有报道，怀孕母猪注射巴氏杆菌菌苗，结果初生仔猪在1～7天内连续发生巴氏杆菌感染。从安全性和某些传染病的传染与流行方面考虑，母猪怀孕的中期和后期，疫苗的注射要慎重。

免疫时的应激。猪怀孕期一般要求环境安静、清洁。注射疫苗时常会出现因人为抓捕及猪只惊叫引起恐慌，往往引起母猪流产。

总之，尽管疫苗接种在理论上和实验试验结果是安全、有效的，但生产中有各种预想不到的应激状态，对疫苗产生不良反应。为安全起见怀孕母猪一般不宜注射接种疫（菌），特别是怀孕中后期更应慎重。在群防免疫时可作出适当的调整和产后补打等措施。对母猪群和后备母猪群要调整免疫程序，不要按一年二次的群防来处置。特别是头胎母猪对重大疾病，如猪瘟、兰耳病、伪狂犬病、乙型脑炎类、猪细小病毒等，需要在母猪怀孕前进行免疫接种；也有部分疫（菌）苗需在怀孕期免疫，如黄白痢病的K88、K99、P978的联合灭活苗，可在怀孕前期免疫接种。对未接种的怀孕期母猪可在母猪产后补接种疫苗。