疫苗是根据免疫学的原理，利用病原微生物本身或其生长繁殖过程中的产物为基础，经过科学加工处理制成的。机体对抗原刺激通过巨噬细胞、T细胞、B细胞和其他免疫因子等共同完成免疫应答反应。因此，理论上讲机体在接受一种、二种或几种抗原刺激时，可以同时产生应答反应。但是免疫反应又是非常复杂的，除受各种因素干扰外，还有我们尚未了解的问题，所以不能笼统的讲两种疫苗能不能同时使用。比如，病毒疫苗和细菌疫苗，一般不能同时使用，因为病毒疫苗制造过程中使用了抗生素，而抗生素对细菌有抑制作用，从而降低了细菌疫苗的免疫效果。

病毒性疫苗二种或二种以上苗的联合使用（联苗）或同时使用，也要具体情况具体对待。因为病毒间存在相互干扰或拮抗现象。目前使用的联苗都是经过试验按不同毒株、不同比例组成，不能盲目将两种或两种以上疫苗联合使用。对于两种疫苗能不能同时接种鸡，那更要慎重，不能盲目创新，更不能为了节省时间、劳力，图省事而同时接种。这样做的结果会出现：一是免疫无效果或达不到预期效果；二是会产生不同程度的负反应，甚至会使鸡群发病、死亡。

很多案例证明，鸡传染性支气管炎疫苗、鸡传染性喉气管炎疫苗会干扰鸡新城疫疫苗的免疫应答，如新城疫疫苗和传染性支气管炎疫苗1:1混合免疫，造成新城疫免疫失败。传染性支气管炎疫苗不能与传染性喉气管炎疫苗同时使用，两者应用应间隔一周以上时间。鸡新城疫疫苗不能与鸡痘苗同时接种，因新城疫病毒干扰鸡痘病毒。鸡法氏囊疫苗虽然是弱毒苗，它又分为中、强、弱等制苗毒株，它们都可对免疫器官造成不同程度的损伤，此时会有一个恢复期，在这个时间段内，机体对任何抗原刺激仅起弱反应或无反应，机体甚至对强毒疫苗产生不良反应，故接种法氏囊疫苗时不宜与其他活苗同时使用。对于鸡的免疫，建议在对鸡保健基础上，按免疫程序，正确使用疫苗。